Ciseri nacque a Ronco sopra Ascona, in Canton Ticino, da Giovan Francesco, anch'egli pittore, e da Caterina Materni.
Trasferitosi a Firenze nel 1833, sviluppò il suo talento artistico presso l'Accademia di Belle Arti con l'aiuto dei maestri Niccola e Pietro Benvenuti.
I suoi dipinti a carattere religioso sono raffaelleschi nel loro stile compositivo e per le loro superfici pulite; tendono a un realismo quasi fotografico.
Dipinse molte opere su commissione da parte di varie chiese in Italia e Svizzera. Dipinse inoltre un gran numero di ritratti, ad esempio di suo suocero Gaetano Bianchini.
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